5.1ch用ドコデモsetにおいて、フロントおよびリアスピーカーを天井から吊り下げた場合と床に置いた（ともに床に座って聴く）場合とでは聴こえ方に差がでるのでしょうか？

天井から吊り下げた場合と床に置いた場合ではさほど聴こえ方に差はありません。
ただ、吊り下げる場合、5.1ch用フロントスピーカーのFC1332はセンター部分からも音が出ていますので、固定してしまう形で吊り下げた場合、センターの角度調節が簡単に出来なくなります。その場合はバンド等を巻いて吊り下げする方法をお薦めいたします。